地球に迫る超巨大侵略獣。ケロン軍本部の援軍も断られ、単身地球を守るために出撃したケロロ小隊。
しかし敵はあまりにも巨大すぎた。宇宙のもくずと散ったケロロ軍曹。はたして地球の運命は！？

【3話(放映3週分)収録】
■第49話
「ケロロ　出没！アド星ック天国　であります」
　全銀河のさまざまな星を紹介する宇宙的大人気番組『出没！アド星ック天国』の制作を協力したケロロ。紹介する星はもちろん地球だ。さっそく、そのオンエアーをみんなでみることに。番組では、これまでケロロの身の回りに起きてきたことをもとに、地球上のいろんな名所が紹介されていく。そしてケロロは、その番組の中にひそかにある計画をもりこんでいた。そして、番組まだ終わっていないというのに「『出没！アド星ック天国』を見た」という宇宙人が訪れてきて…。
■第50話
「ケロケロ作戦　第１００号　であります」
　記念すべき100個目の侵略作戦である「ちゃぶ台に弁慶の泣き所作戦」を実行に移すケロロたち。それは、もっとも痛い角度と高さでスネにぶつかっていくようプログラミングされた自走式ちゃぶ台メカを大量生産して全世界にばらまくというもの。しかし、生産中のちゃぶ台メカが、宇宙からのナゾの電磁波により暴走を開始してしまった。なんとかその騒動は収拾させたケロロたち。だが、電磁波の元となった超宇宙巨大侵略獣が地球に迫っていて…。
■第51話
「ケロロ　さらばケロロ軍曹　であります」
　地球に迫ってきた超巨大侵略獣に打ちのめされたケロロ小隊。そのころ地　球では、西澤家の科学班が侵略獣の存在をキャッチしていた。ケロロの行方を心配する冬樹たち。そのとき、モアが宇宙人街で巨大宇宙船を発見。ポヨンによると、その宇宙船は巨大ロボットに変形できるという。冬樹、夏美たちが巨大宇宙船で出動しようとしたそのとき、ポッドに乗ってなんとか脱出してきたケロロたちが地球に帰還してきた。宇宙船に乗り込んだケロロたちは、巨大ロボへの変形を開始。侵略獣に最後の戦いをいどむ！

製作年度：2006

第49話　脚本：北嶋博明／演出：福本 潔／絵コンテ：米田和博／作画監督：石井ゆみ子
第50話　脚本：横谷昌宏／演出：清水一伸／絵コンテ：石平信司／作画監督：飯飼一幸
第51話　脚本：横谷昌宏／演出：徳本善信／絵コンテ：近藤信宏／作画監督：小池智史

企画：サンライズ／原作：吉崎観音（角川書店少年エース連載）／監修：佐藤順一／監督：近藤信宏／シリーズ構成：横谷昌弘／音楽：鈴木さえ子／キャラクターデザイン：追崎史敏／美術監修：田尻健一／美術監督：駒田 寛／色彩設計：舟田圭一／撮影監督：福士 亨／編集：板部浩章／音響監督：鶴岡陽太／製作：テレビ東京・ＮＡＳ・サンライズ　他

ケロロ軍曹：渡辺久美子／タママ二等兵：小桜エツ子／ギロロ伍長：中田譲治／クルル曹長：子安武人／ドロロ兵長：草尾 毅／日向冬樹：川上とも子／日向夏美：斎藤千和／日向 秋：平松晶子／アンゴル・モア：能登麻美子／西澤桃華：池澤春菜／東谷小雪：広橋 涼／ナレーション＆ポール森山：藤原啓治　他